Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SRGAP3O43295 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRGAP3O43295 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms