Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PTPRTO14522 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPRTO14522 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
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