Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNAP23O00161 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNAP23O00161 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms