Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PALM3A6NDB9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PALM3A6NDB9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms