Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA3AA6NCI4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms