Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gria4Q9Z2W8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gria4Q9Z2W8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gria4Q9Z2W8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gria4Q9Z2W8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gria4Q9Z2W8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gria4Q9Z2W8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gria4Q9Z2W8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gria4Q9Z2W8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms