Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTI7

Myo1c, Unconventional myosin-Ic, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1cQ9WTI7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Myo1cQ9WTI7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Myo1cQ9WTI7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Myo1cQ9WTI7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Myo1cQ9WTI7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Myo1cQ9WTI7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Myo1cQ9WTI7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms