Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Q9

Atp6ap1, V-type proton ATPase subunit S1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1Q9R1Q9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atp6ap1Q9R1Q9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atp6ap1Q9R1Q9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atp6ap1Q9R1Q9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atp6ap1Q9R1Q9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atp6ap1Q9R1Q9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp6ap1Q9R1Q9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms