Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RHBDL2Q9NX52 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDL2Q9NX52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDL2Q9NX52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHBDL2Q9NX52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHBDL2Q9NX52 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms