Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SOX17Q9H6I2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX17Q9H6I2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX17Q9H6I2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOX17Q9H6I2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms