Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cmtm2bQ9DAC0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm2bQ9DAC0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cmtm2bQ9DAC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cmtm2bQ9DAC0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms