Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc70Q9D9B0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc70Q9D9B0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc70Q9D9B0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc70Q9D9B0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc70Q9D9B0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc70Q9D9B0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc70Q9D9B0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc70Q9D9B0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms