Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn23Q9D7D7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn23Q9D7D7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn23Q9D7D7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn23Q9D7D7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn23Q9D7D7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms