Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Psmd8Q9CX56 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd8Q9CX56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd8Q9CX56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd8Q9CX56 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms