Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdzk1ip1Q9CQH0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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