Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VAMP8Q9BV40 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VAMP8Q9BV40 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP8Q9BV40 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
VAMP8Q9BV40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP8Q9BV40 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms