Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
4930550L24RikQ99PA7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
4930550L24RikQ99PA7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4930550L24RikQ99PA7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
4930550L24RikQ99PA7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4930550L24RikQ99PA7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4930550L24RikQ99PA7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms