Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PpifQ99KR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PpifQ99KR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PpifQ99KR7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PpifQ99KR7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PpifQ99KR7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms