Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
LYSTQ99698 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LYSTQ99698 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LYSTQ99698 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LYSTQ99698 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LYSTQ99698 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms