Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
LRRC7Q96NW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
LRRC7Q96NW7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
LRRC7Q96NW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
LRRC7Q96NW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.16■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
LRRC7Q96NW7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
LRRC7Q96NW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.04■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
LRRC7Q96NW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRRC7Q96NW7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRRC7Q96NW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRRC7Q96NW7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC7Q96NW7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC7Q96NW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
LRRC7Q96NW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms