Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ALPK3Q96L96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALPK3Q96L96 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ALPK3Q96L96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ALPK3Q96L96 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ALPK3Q96L96 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ALPK3Q96L96 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ALPK3Q96L96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ALPK3Q96L96 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms