Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SERAC1Q96JX3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SERAC1Q96JX3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERAC1Q96JX3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SERAC1Q96JX3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SERAC1Q96JX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms