Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc9Q8VC31 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc9Q8VC31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ccdc9Q8VC31 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ccdc9Q8VC31 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc9Q8VC31 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc9Q8VC31 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc9Q8VC31 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc9Q8VC31 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms