Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00528Q8N1L1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00528Q8N1L1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00528Q8N1L1 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms