Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00518Q8N0U6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LINC00518Q8N0U6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LINC00518Q8N0U6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LINC00518Q8N0U6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.7 ms