Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn3Q8BHH8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clrn3Q8BHH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clrn3Q8BHH8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clrn3Q8BHH8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clrn3Q8BHH8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clrn3Q8BHH8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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