Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GypcQ78HU7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GypcQ78HU7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GypcQ78HU7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GypcQ78HU7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GypcQ78HU7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GypcQ78HU7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GypcQ78HU7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GypcQ78HU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GypcQ78HU7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms