Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Snx13Q6PHS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Snx13Q6PHS6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Snx13Q6PHS6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Snx13Q6PHS6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Snx13Q6PHS6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snx13Q6PHS6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snx13Q6PHS6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms