Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
2810408A11RikQ6NSU2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
2810408A11RikQ6NSU2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
2810408A11RikQ6NSU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
2810408A11RikQ6NSU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
2810408A11RikQ6NSU2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms