Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScxQ64124 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScxQ64124 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScxQ64124 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScxQ64124 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ScxQ64124 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ScxQ64124 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ScxQ64124 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScxQ64124 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ScxQ64124 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ScxQ64124 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms