Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Trpc6Q61143 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trpc6Q61143 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trpc6Q61143 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trpc6Q61143 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trpc6Q61143 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Trpc6Q61143 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trpc6Q61143 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trpc6Q61143 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms