Protein–RNA interactions for Protein: Q60854

Serpinb6, Serpin B6, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb6Q60854 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Serpinb6Q60854 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Serpinb6Q60854 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,33■■□□□ 1,65
Serpinb6Q60854 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Serpinb6Q60854 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25,3■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Serpinb6Q60854 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,22■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Serpinb6Q60854 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Serpinb6Q60854 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Serpinb6Q60854 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Serpinb6Q60854 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Serpinb6Q60854 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms