Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
PPRC1Q5VV67 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PPRC1Q5VV67 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
PPRC1Q5VV67 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
PPRC1Q5VV67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PPRC1Q5VV67 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PPRC1Q5VV67 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PPRC1Q5VV67 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.1
PPRC1Q5VV67 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PPRC1Q5VV67 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PPRC1Q5VV67 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
PPRC1Q5VV67 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PPRC1Q5VV67 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
PPRC1Q5VV67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms