Protein–RNA interactions for Protein: Q5IJ48

CRB2, Protein crumbs homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB2Q5IJ48 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CRB2Q5IJ48 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CRB2Q5IJ48 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRB2Q5IJ48 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRB2Q5IJ48 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CRB2Q5IJ48 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CRB2Q5IJ48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms