Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Thsd4Q3UTY6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Thsd4Q3UTY6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Thsd4Q3UTY6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Thsd4Q3UTY6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thsd4Q3UTY6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thsd4Q3UTY6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms