Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mindy4Q3UQI9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mindy4Q3UQI9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mindy4Q3UQI9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mindy4Q3UQI9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mindy4Q3UQI9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mindy4Q3UQI9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms