Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdkl4Q3TZA2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdkl4Q3TZA2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cdkl4Q3TZA2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdkl4Q3TZA2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdkl4Q3TZA2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdkl4Q3TZA2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms