Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATMQ13315 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMQ13315 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATMQ13315 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMQ13315 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMQ13315 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATMQ13315 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMQ13315 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMQ13315 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMQ13315 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMQ13315 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATMQ13315 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMQ13315 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMQ13315 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMQ13315 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMQ13315 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATMQ13315 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMQ13315 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATMQ13315 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMQ13315 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMQ13315 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMQ13315 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATMQ13315 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATMQ13315 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMQ13315 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMQ13315 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATMQ13315 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMQ13315 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMQ13315 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMQ13315 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATMQ13315 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATMQ13315 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATMQ13315 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMQ13315 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMQ13315 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMQ13315 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMQ13315 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATMQ13315 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMQ13315 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMQ13315 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMQ13315 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATMQ13315 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATMQ13315 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMQ13315 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMQ13315 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMQ13315 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATMQ13315 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATMQ13315 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATMQ13315 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ATMQ13315 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATMQ13315 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATMQ13315 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATMQ13315 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATMQ13315 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATMQ13315 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATMQ13315 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATMQ13315 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATMQ13315 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATMQ13315 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATMQ13315 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATMQ13315 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATMQ13315 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATMQ13315 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATMQ13315 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATMQ13315 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATMQ13315 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATMQ13315 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATMQ13315 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATMQ13315 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATMQ13315 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATMQ13315 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMQ13315 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMQ13315 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMQ13315 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATMQ13315 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMQ13315 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMQ13315 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATMQ13315 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMQ13315 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATMQ13315 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATMQ13315 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMQ13315 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMQ13315 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMQ13315 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMQ13315 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ATMQ13315 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATMQ13315 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
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