Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rad50P70388 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad50P70388 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rad50P70388 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad50P70388 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad50P70388 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad50P70388 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rad50P70388 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad50P70388 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rad50P70388 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Rad50P70388 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad50P70388 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rad50P70388 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rad50P70388 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad50P70388 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad50P70388 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad50P70388 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad50P70388 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad50P70388 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad50P70388 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad50P70388 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms