Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gabra1P62812 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gabra1P62812 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gabra1P62812 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Gabra1P62812 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1944.2 ms