Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp25P57080 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Usp25P57080 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp25P57080 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp25P57080 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp25P57080 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp25P57080 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp25P57080 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp25P57080 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp25P57080 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp25P57080 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp25P57080 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp25P57080 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Usp25P57080 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp25P57080 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp25P57080 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Usp25P57080 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp25P57080 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Usp25P57080 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Usp25P57080 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp25P57080 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182 ms