Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nkx2-5P42582 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nkx2-5P42582 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-5P42582 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-5P42582 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nkx2-5P42582 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-5P42582 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms