Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TtlP38585 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TtlP38585 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TtlP38585 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TtlP38585 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TtlP38585 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TtlP38585 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TtlP38585 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TtlP38585 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TtlP38585 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TtlP38585 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TtlP38585 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TtlP38585 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TtlP38585 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TtlP38585 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TtlP38585 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TtlP38585 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TtlP38585 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TtlP38585 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TtlP38585 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TtlP38585 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TtlP38585 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TtlP38585 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TtlP38585 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TtlP38585 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TtlP38585 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TtlP38585 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TtlP38585 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TtlP38585 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TtlP38585 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TtlP38585 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TtlP38585 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TtlP38585 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TtlP38585 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TtlP38585 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TtlP38585 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TtlP38585 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TtlP38585 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TtlP38585 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TtlP38585 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TtlP38585 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TtlP38585 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TtlP38585 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TtlP38585 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TtlP38585 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TtlP38585 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TtlP38585 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TtlP38585 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtlP38585 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TtlP38585 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TtlP38585 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtlP38585 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TtlP38585 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TtlP38585 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TtlP38585 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TtlP38585 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TtlP38585 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TtlP38585 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TtlP38585 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TtlP38585 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtlP38585 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TtlP38585 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TtlP38585 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TtlP38585 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TtlP38585 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TtlP38585 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TtlP38585 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TtlP38585 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TtlP38585 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TtlP38585 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TtlP38585 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TtlP38585 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TtlP38585 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtlP38585 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtlP38585 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TtlP38585 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TtlP38585 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TtlP38585 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TtlP38585 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TtlP38585 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TtlP38585 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TtlP38585 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TtlP38585 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TtlP38585 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TtlP38585 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtlP38585 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TtlP38585 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtlP38585 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtlP38585 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TtlP38585 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtlP38585 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtlP38585 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TtlP38585 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtlP38585 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TtlP38585 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms