Protein–RNA interactions for Protein: P29558

RBMS1, RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBMS1P29558 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RBMS1P29558 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RBMS1P29558 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBMS1P29558 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RBMS1P29558 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBMS1P29558 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms