Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms