Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NfyaP23708 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NfyaP23708 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NfyaP23708 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NfyaP23708 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NfyaP23708 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NfyaP23708 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NfyaP23708 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NfyaP23708 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NfyaP23708 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms