Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tgfb3P17125 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tgfb3P17125 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tgfb3P17125 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tgfb3P17125 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tgfb3P17125 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tgfb3P17125 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms