Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChgbP16014 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChgbP16014 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgbP16014 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ChgbP16014 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ChgbP16014 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgbP16014 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ChgbP16014 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChgbP16014 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChgbP16014 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ChgbP16014 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ChgbP16014 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ChgbP16014 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChgbP16014 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ChgbP16014 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ChgbP16014 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ChgbP16014 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChgbP16014 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChgbP16014 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ChgbP16014 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChgbP16014 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChgbP16014 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChgbP16014 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ChgbP16014 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgbP16014 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgbP16014 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgbP16014 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ChgbP16014 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms