Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf4P11403 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fgf4P11403 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Fgf4P11403 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fgf4P11403 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fgf4P11403 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fgf4P11403 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fgf4P11403 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf4P11403 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf4P11403 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fgf4P11403 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fgf4P11403 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms