Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD8BP10966 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD8BP10966 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8BP10966 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD8BP10966 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8BP10966 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8BP10966 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8BP10966 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD8BP10966 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD8BP10966 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD8BP10966 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD8BP10966 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8BP10966 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8BP10966 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD8BP10966 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8BP10966 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD8BP10966 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD8BP10966 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD8BP10966 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD8BP10966 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8BP10966 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8BP10966 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8BP10966 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD8BP10966 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD8BP10966 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD8BP10966 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8BP10966 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8BP10966 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8BP10966 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD8BP10966 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8BP10966 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD8BP10966 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8BP10966 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8BP10966 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8BP10966 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD8BP10966 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8BP10966 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8BP10966 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CD8BP10966 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8BP10966 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD8BP10966 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8BP10966 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8BP10966 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8BP10966 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8BP10966 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CD8BP10966 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8BP10966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8BP10966 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8BP10966 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8BP10966 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD8BP10966 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD8BP10966 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8BP10966 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8BP10966 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD8BP10966 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8BP10966 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8BP10966 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8BP10966 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8BP10966 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD8BP10966 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8BP10966 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8BP10966 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8BP10966 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8BP10966 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD8BP10966 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD8BP10966 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD8BP10966 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CD8BP10966 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8BP10966 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD8BP10966 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms