Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APELAP0DMC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
APELAP0DMC3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APELAP0DMC3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APELAP0DMC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms